PCR:聚合酶链式反应(Polymerase Chain Reaction, PCR),一种用于放大扩增特定的DNA片段的分子生物学技术,它可看作是生物体外的特殊DNA复制,PCR的大特点,是能将微量的DNA大幅增加。PCR的原理:PCR的基本过程类似于DNA的天然复制,特异性依赖于与靶序列两端互补的Oligo引物。整个过程由变性-退火-延伸3个基本反应步骤构成。
PCR实验中扩增产物在凝胶中涂布或成片状条带弥散的原因如下:
(1)酶量过高。减少酶量;酶的质量差,调换另一来源的酶。
(2)dNTP浓度过高。减少dNTP的浓度。
(3)MgCl2浓度过高。可适当降低其用量。
(4)模板量过多。质粒DNA的用量应<50ng,而基因组DNA则应<200ng。
(5)引物浓度不够优化。对引物进行梯度稀释重复PCR反应。
(6)循环次数过多;增加模板量减少循环次数至30,缩短退火时间及延伸时间,或改用二种温度的PCR循环。
(7)退火温度过低。
(8)电泳体系有问题:
①凝胶中缓冲液和电泳缓冲液浓度相差太大;
②凝胶没有凝固好;
③琼脂糖质量差。
(9)若为PCR试剂盒则可能:
①由于运输储存不当引起试剂盒失效;
②试剂盒本身质量有问题,如引物选择、循环参数等选择不当。
(10)降解的陈旧模板扩增也易产生涂布。